Coarse-grained molecular dynamics and continuum models for the transport of protein molecules
- Marco Bacci,
The present work makes use of coarse-grained molecular dynamics simulations and continuum models to investigate the behavior of biomolecules in experiments such as mechanical pulling and driven transport across nanopores. The approach reproduces the wide phenomenology of experiments and allows one to maintain the main features of the transport by modeling the process as a 1D dynamics in a suited potential of the mean force. The standard 1D continuum view is enriched by proposing a model for the description of the shape of isolated
molecules based on a tensorial representation and Cauchy-Born rule. Results indicate limitations for unconstrained dynamics and appropriateness for driven ones.
- DOI: 10.36253/978-88-6655-694-7
- Collana: Premio Tesi di Dottorato
- Comitato scientifico
- Lingua: Inglese
- Argomento: Biochimica Chimica
University of Zurich , Switzerland
- Anno di pubblicazione: 2014
- Pagine: 134
- eISBN: 978-88-6655-694-7
- Licenza d'uso: CC BY 4.0
- © 2014 Author(s)
- Anno di pubblicazione: 2014
- Pagine: 134
- ISBN: 978-88-6655-693-0
- Licenza d'uso: CC BY 4.0
- © 2014 Author(s)
Informazioni bibliografiche
Titolo del libro
Coarse-grained molecular dynamics and continuum models for the transport of protein molecules
Autori
Marco Bacci
Opera sottoposta a peer review
Numero di pagine
134
Anno di pubblicazione
2014
Copyright
© 2014 Author(s)
Licenza d'uso
Licenza dei metadati
Editore
Firenze University Press
DOI
10.36253/978-88-6655-694-7
ISBN Print
978-88-6655-693-0
eISBN (pdf)
978-88-6655-694-7
eISBN (xml)
978-88-9273-417-3
Collana
Premio Tesi di Dottorato
ISSN della collana
2612-8039
e-ISSN della collana
2612-8020
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